File:Intergen51.fc+7-40.png

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Description

Projet de recherche: Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes. L'étude des intercalaires cds..cds permet de les comparer aux intercalaires cds..RNA et RNA..RNA. Les diagrammes des fréquences des intercalaires cds..cds positifs continus de 1 à 40 pbs présentés ici regroupent 12 génomes de la classe X du tableau du classement des diagrammes fc40. Sur cette image les classes sont indiquées sur l'intercalaire horizontal entre les lignes de diagrammes.

Les abscisses sont les fréquences unitaires et les ordonnées leurs pourcentages en pour 1000 ‰ par rapport au total des intercalaires positifs continus. La courbe de tendance est un polynôme de d°12 (poly 12) représentée par son coefficient de détermination R2. Y est ajouté le total des intercalaires (total).
Le calcul de l'intercalaire est fait méthodiquement sur le tableur calc de LibreOfiice.
Voir la construction de ces diagrammes dans la page de chaque génome xxx intergen51 où xxx est le code KEGG [1]. Cette page présente
- le gènome en détail dont le lien à la source des donnée NCBI,
- permet de retrouver les 2 colonnes du diagramme dans les données intercalaires
- et présente les courbes de tendances sous forme de plynômes de d°3 dans les diagrammes CDS-CDS positifs.
Les liens à ces pages sont
- les classes de X11 à X15     myr    blo    fps    absp    pmg
- les classes de X21 à X28     pub    abq    npu    sma    ksk     rpl    aua
- La classe X25, rtb n'est pas présentée ici parce qu'elle a la même phylogénie que rpl.
Source Own work Edit this at Structured Data on Commons
Author Mekkiwik

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current08:29, 9 September 2024Thumbnail for version as of 08:29, 9 September 20241,797 × 851 (345 KB)Mekkiwik (talk | contribs)mise à jour des diagrammes de abq aua
09:26, 31 March 2023Thumbnail for version as of 09:26, 31 March 20231,689 × 773 (285 KB)Mekkiwik (talk | contribs)Changement des représentations
20:05, 31 January 2022Thumbnail for version as of 20:05, 31 January 2022910 × 760 (162 KB)Mekkiwik (talk | contribs)mise à jour sur les effectifs après le contrôle du 25.1.22. Normalistion des étiquettes.
17:30, 28 October 2021Thumbnail for version as of 17:30, 28 October 2021871 × 716 (149 KB)Mekkiwik (talk | contribs){{Information |Description=Projet de recherche: Les clusters de gènes tRNA et rRNA chez les procaryotes. L'étude des intercalaires cds..cds permet de les comparer aux intercalaires cds..RNA et RNA..RNA. Les diagrammes des fréquences des intercalaires cds..cds positifs et continus de 1 à 40 pbs se sont révélés intéressants parce qu'ils présentent des courbes semblables. :Le [[v:fr:Recherche:Les_clusters_de_g%C3%A8nes_tR...

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