File:سير عمل المجهر الإلكتروني المبرد.svg
Original file (SVG file, nominally 512 × 384 pixels, file size: 1.25 MB)
Captions
Captions
Summary
[edit]
| Description |
English: سير العمل لتجربة cryo-EM النموذجية يمكن تقسيمه إلى عدة مراحل، بما في ذلك تحضير العينة، تحضير الشبكة، جمع البيانات، معالجة الصور، وتحديد الهيكل. فيما يلي نظرة عامة موجزة على كل مرحلة:
تحضير العينة: يتضمن ذلك تنقية العينة البيولوجية المهتمة، مثل بروتين أو مجمع بروتيني أو فيروس أو خلية. يجب أن تكون العينة في حالة نقية ومتجانسة، خالية من الملوثات والتكتلات. اعتمادًا على العينة، يمكن استخدام تقنيات مختلفة مثل الكروماتوغرافيا بالحجم الحجمي، أو الكروماتوغرافيا الكفافية، أو الطرق الألتراسنتريفيوجية للتنقية. تحضير الشبكة: ثم يتم تطبيق العينة المنقاة على نوع خاص من شبكة الميكروسكوب الإلكتروني، المصنوعة عادة من الكربون أو الذهب. يتم معالجة الشبكة أولاً بطبقة رقيقة من بوليمر هيدروفيليكي لمنع العينة من التمسك بالشبكة. ثم يتم تطبيق العينة على الشبكة، ويتم تجفيف الفائض من العامل. ثم يتم تجميد الشبكة بسرعة في إيثان أو بروبان السائليين لإنشاء طبقة رقيقة من الثلج المجمد حول العينة. جمع البيانات: تحمل الشبكات المجمدة إلى الميكروسكوب الإلكتروني cryo-EM، ويتم جمع الصور باستخدام شعاع إلكتروني. يمكن تشغيل الميكروسكوب بوضعيات تلقائية أو يدوية. في الوضع التلقائي، يختار برنامج الميكروسكوب تلقائيًا الشبكات ويحصل على صور من مناطق مختلفة على الشبكة. في الوضع اليدوي، يقوم المستخدم بتحديد مناطق الاهتمام على الشبكة يدويًا. عادةً ما يتم جمع المئات إلى الآلاف من الصور من زوايا مختلفة، والتي يتم استخدامها للمعالجة اللاحقة. معالجة الصور: تتم معالجة الصور المجمعة لتحسين جودتها وتوليد إعمار ثلاثية الأبعاد للعينة. يتضمن ذلك عدة خطوات، بما في ذلك اختيار الجسيمات، وتصنيف البعد الثنائي، والمتوسط، والتكرار. في اختيار الجسيمات، يتم التعرف واستخراج الجسيمات الفردية في الصور. في تصنيف البعد الثنائي، يتم فرز الجسيمات إلى فئات مختلفة بناءً على توجيهاتها وتشابهها. في إعمار ثلاثي الأبعاد، يتم استخدام الجسيمات المرتبة لتوليد خريطة كثافة ثلاثية الأبعاد للعينة. بناء النموذج والتكرار: بمجرد الحصول على الخريطة ثلاثية الأبعاد، يمكن بناء نموذج هيكلي للبروتين أو المجمع باستخدام الأساليب الحسابية. يتم تكرار تحسين النموذج بشكل تكراري من خلال مقارنته بخريطة cryo-EM وإجراء التعديلات حتى الحصول على نموذج عالي الجودة. يمكن تحليل النموذج الهيكلي لاكتساب رؤى حول هيكل ووظيفة البروتين أو المجمع، مثل فهم كيفية تفاعله مع جزيئات أخرى أو كيف يحفز التفاعلات الكيميائية. |
| Date | 30 June 2023 |
| Source | https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Cryogenic_electron_microscopy_workflow.svg |
| Author | Hira Khan |
Licensing
[edit]
- You are free:
- to share – to copy, distribute and transmit the work
- to remix – to adapt the work
- Under the following conditions:
- attribution – You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use.
- share alike – If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same or compatible license as the original.
File history
Click on a date/time to view the file as it appeared at that time.
| Date/Time | Thumbnail | Dimensions | User | Comment | |
|---|---|---|---|---|---|
| current | 11:39, 30 June 2023 | | 512 × 384 (1.25 MB) | OAnick (talk | contribs) | Uploaded a work by Hira Khan from https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Cryogenic_electron_microscopy_workflow.svg with UploadWizard |
You cannot overwrite this file.
File usage on Commons
The following page uses this file:
